109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0585 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  59.68 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  59.68 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  57.94 
 
 		 260 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  58.57 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  59.63 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 280 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  45.74 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  59.36 
 
 		 326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  46.61 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  39.04 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  34.96 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  34.96 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  34.96 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  35.21 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  35.21 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  35.21 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  34.59 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  35.75 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  31.9 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  32.48 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  32.48 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  36.31 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  24.08 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  53.03 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1614  hypothetical protein  56.25 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  23.83 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  55.56 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  22.64 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  24.21 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  25.65 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  25.65 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  26.24 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  26.24 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  26.24 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  26.24 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  23.32 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  26.5 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  23.68 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  23.85 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3432  transposase IS4 family protein  27.94 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3429  transposase IS4 family protein  27.94 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  22.69 
 
 		 330 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  22.69 
 
 		 330 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  22.69 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  22.69 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  22.69 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  22.69 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3942  transposase, IS4 family protein  24.07 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  23.32 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  24.38 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>