19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4311 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  100 
 
 		 241 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  89.63 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  89.63 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  68.88 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  64.83 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  57.74 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  48.95 
 
 		 271 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  48.93 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  32.49 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  31.69 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  28.57 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  23.63 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  27.07 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  22.8 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  30.4 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  21.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  21.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.66 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>