More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4223 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4223  parB-like partition proteins  100 
 
 		 430 aa  880    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6266  nuclease  27.96 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  37.75 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  37.5 
 
 		 296 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  37.18 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.95 
 
 		 292 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  35.51 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  29.29 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  47.83 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  37.32 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  34.48 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  38.03 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  35.25 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  32.6 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.25 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  32.6 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  35.25 
 
 		 305 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  36.62 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  36.62 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  36.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  36.62 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  36.62 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  35.25 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  35.9 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  34.84 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  37.68 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  35.81 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  35.9 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  51.06 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  30.64 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  34.53 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  36.5 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.23 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  35.25 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  35.92 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  42.74 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  36.23 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  35.25 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  34.19 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.51 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  34.9 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  36.96 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  38.41 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  34.51 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  39.42 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  35.97 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  48.89 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34.06 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.17 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.23 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  41.27 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.06 
 
 		 310 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  35.94 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  34.78 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  36.76 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  38.03 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  38.03 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  44.44 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  36.88 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  35.77 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  45.71 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  36.88 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  35.25 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  39.23 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.41 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  34.53 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  35.66 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  37.68 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  39.84 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  32.41 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  50 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  35.88 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  50 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  42 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  35.11 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  35.11 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  35.11 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>