31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2646 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1000    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1000    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  27.8 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  31.63 
 
 
344 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  30.39 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  31.05 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  31.05 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  32.32 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  23.53 
 
 
342 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  24.24 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  24.24 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  22.49 
 
 
433 aa  60.1  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  26.46 
 
 
306 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  29.03 
 
 
568 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  39.44 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  39.44 
 
 
342 aa  54.7  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  25.53 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  38.3 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  27.78 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  30.51 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  22.96 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  22.96 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  28.48 
 
 
849 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  28.48 
 
 
849 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  22.45 
 
 
268 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  23.83 
 
 
183 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  30.65 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  37.31 
 
 
438 aa  43.5  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>