21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0772 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  45.77 
 
 		 1279 aa  968    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1296 aa  2549    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  58.97 
 
 		 1345 aa  1449    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  29.96 
 
 		 1343 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  29.99 
 
 		 1332 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1306 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1368 aa  326  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  27.13 
 
 		 1332 aa  320  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1249 aa  304  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  28.9 
 
 		 944 aa  251  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  28.12 
 
 		 1327 aa  246  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  27.96 
 
 		 942 aa  231  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1190 aa  184  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  21.71 
 
 		 942 aa  91.7  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1193 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.61 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1193 aa  69.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 900 aa  67.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  32.33 
 
 		 299 aa  67.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1903  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1062 aa  50.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0536  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  46.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.120824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>