More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2014 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 273 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  69.44 
 
 		 250 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  47.96 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  47.96 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  47.96 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  69.87 
 
 		 162 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  44.53 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  44.53 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  44.53 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  71.23 
 
 		 148 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 284 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  44.27 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  46.46 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  44.57 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  44.57 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  42.14 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  44.79 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  42.14 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  41.85 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  43.75 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  42.91 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  42.97 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  41.79 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  41.36 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  40.62 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  40.55 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  42.08 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  42.08 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  42.08 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  40.16 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  43.75 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  43.89 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  43.36 
 
 		 277 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0884  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  43.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>