256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0311 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 		 460 aa  905    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.96 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  48.96 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.68 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  54.71 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  49.04 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  49.11 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  47.51 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.75 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  52.51 
 
 		 475 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  47.9 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  46.84 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.05 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  53.05 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  48.61 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  48.84 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.67 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  48.35 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  48.35 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  48.35 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.53 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  48.45 
 
 		 463 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  49.57 
 
 		 477 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  44.57 
 
 		 478 aa  359  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  48.45 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  40.3 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  39.79 
 
 		 487 aa  343  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.31 
 
 		 505 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.46 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  49.48 
 
 		 459 aa  338  8e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  54.45 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  40.47 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.27 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  39.29 
 
 		 512 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  39.96 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.82 
 
 		 510 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  38.72 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  42.6 
 
 		 473 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.81 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  25.91 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.37 
 
 		 358 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.37 
 
 		 358 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.01 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  32.09 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  32.86 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.33 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.4 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.25 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.91 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  28.7 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.25 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  29.76 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.58 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  30.85 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  30.85 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.81 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  28.5 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.8 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.25 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.7 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.09 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.67 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.88 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.6 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.95 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.77 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  29.95 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.32 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.73 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.11 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.11 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.9 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000906257  hitchhiker  0.00000551742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.39 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  26.44 
 
 		 296 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  26.44 
 
 		 296 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.11 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.28 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.77 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.19 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  30.67 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  29.13 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.35 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.36 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.77 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.66 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.85 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.34 
 
 		 324 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.7 
 
 		 326 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  30 
 
 		 323 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.03 
 
 		 317 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  26.5 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.37 
 
 		 370 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  29.38 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.82 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.77 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  24 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  25.74 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>