56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0006 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  63.08 
 
 		 499 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  65.15 
 
 		 497 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 512 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  77.02 
 
 		 510 aa  789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  65.83 
 
 		 510 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  60.54 
 
 		 487 aa  594  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  57.97 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  56.49 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.78 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.29 
 
 		 486 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.21 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  48.58 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  47.15 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.24 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  44.29 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  43.25 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  50.86 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  51.3 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.73 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  40.77 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.32 
 
 		 465 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  47.38 
 
 		 511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  42.27 
 
 		 473 aa  326  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.12 
 
 		 463 aa  325  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  47.29 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  45.92 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  45.92 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  45.92 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.46 
 
 		 476 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.76 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.29 
 
 		 460 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  38.38 
 
 		 469 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  39.45 
 
 		 480 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  46.15 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  37.66 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  46.84 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.99 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  37.82 
 
 		 477 aa  287  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.69 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.02 
 
 		 664 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0445  magnesium chelatase  25.63 
 
 		 402 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.57 
 
 		 304 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.54 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2027  AAA ATPase  28.21 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.94 
 
 		 678 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.8 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  28.21 
 
 		 307 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.6 
 
 		 672 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  25 
 
 		 800 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  27.44 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  27.19 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  37.31 
 
 		 632 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.48 
 
 		 611 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  26.98 
 
 		 683 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.84 
 
 		 673 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.84 
 
 		 673 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>