138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0090 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 		 477 aa  931    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  67.67 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  67.17 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  67.45 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  67.67 
 
 		 465 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  67.39 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  66.39 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  68.57 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  59.45 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  63.92 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  60 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  61.17 
 
 		 461 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  57.71 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  57.24 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  56.11 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  58.17 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  57.3 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  57.55 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  56.52 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  58.61 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  58.61 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  58.61 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  59.62 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  60.47 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.69 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.57 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.67 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.52 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.19 
 
 		 505 aa  359  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.72 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  39.41 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  43.95 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.44 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  39.62 
 
 		 487 aa  333  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  38.45 
 
 		 497 aa  329  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  37.47 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  38.99 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  38 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  37.82 
 
 		 512 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.53 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.6 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.6 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.54 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  33.66 
 
 		 334 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.49 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.45 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  33.68 
 
 		 660 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  33.16 
 
 		 669 aa  63.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.38 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.28 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.41 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.63 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.69 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.94 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.46 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.9 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.9 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.14 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  28.1 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.92 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  28.1 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  32.5 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  32.5 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.46 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.17 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  26.7 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.7 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.99 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  32.81 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.83 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.42 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.91 
 
 		 340 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  30.1 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  29.12 
 
 		 334 aa  53.9  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  32.28 
 
 		 670 aa  53.9  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  31.28 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  30.37 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  27.54 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.6 
 
 		 304 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  32.26 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.34 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  24.76 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.37 
 
 		 363 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  30.11 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5417  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.14 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.7 
 
 		 326 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.84 
 
 		 362 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.01 
 
 		 306 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.57 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  29.9 
 
 		 362 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.17 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  24.07 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  24.91 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  25.09 
 
 		 626 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.51 
 
 		 324 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  34.07 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0878  hypothetical protein  29.89 
 
 		 321 aa  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000906257  hitchhiker  0.00000551742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.14 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>