46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3382 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3529  hypothetical protein  88.97 
 
 		 390 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.716011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3465  hypothetical protein  88.72 
 
 		 390 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3443  hypothetical protein  56.06 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264114  normal  0.476005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4071  histidine kinase HAMP region domain protein  47.55 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3961  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.71 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4104  histidine kinase HAMP region domain protein  46.11 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  37.19 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 822 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3654  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 822 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 622 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0885  hypothetical protein  32.53 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 587 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 679 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 599 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1275 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 		 1398 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 678 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1397 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.84 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 777 aa  63.5  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  24.32 
 
 		 712 aa  63.2  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  31.72 
 
 		 761 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.47 
 
 		 619 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.66 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 634 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 636 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.15 
 
 		 637 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.54 
 
 		 651 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 655 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 634 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.32 
 
 		 634 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 633 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  28.43 
 
 		 637 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 649 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 633 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 633 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 633 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.95 
 
 		 667 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.38 
 
 		 646 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  20.1 
 
 		 532 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.97 
 
 		 651 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0785  diguanylate cyclase  27.34 
 
 		 502 aa  42.7  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>