81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2757 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0393981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2941  hypothetical protein  98.22 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2849  hypothetical protein  97.78 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2746  hypothetical protein  77.97 
 
 		 233 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.730297  normal  0.780622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6277  hypothetical protein  46.47 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0414  hypothetical protein  30.95 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.64 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  23.04 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  24.43 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  23.61 
 
 		 392 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  26.19 
 
 		 364 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.61 
 
 		 392 aa  52  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.85 
 
 		 392 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.61 
 
 		 392 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.72 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.72 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.72 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.72 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.61 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.48 
 
 		 392 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  26.79 
 
 		 368 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  23.63 
 
 		 390 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  23.63 
 
 		 390 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0988  tetraheme cytochrome c  22.73 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  23.63 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2936  NapC/NirT cytochrome c domain protein  24.1 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.441265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2983  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  25.98 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000569664  normal  0.0718991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  23.68 
 
 		 392 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1912  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  26.2 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00847918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  26.46 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2678  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  21.65 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.401671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.08 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.08 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.49 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000671983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.08 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  23.08 
 
 		 394 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  28.83 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0954  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  22.5 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.08 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  26.34 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  26.34 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  26.17 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  23.7 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  26.34 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1938  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  26.56 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00561646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2551  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family protein  22 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1945  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  26.2 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2381  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  26.2 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000554571  normal  0.329531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  22.67 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  22.56 
 
 		 392 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  28.49 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  25.71 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003774  putative cytochrome c-type protein  24.1 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4207  cytochrome c-type protein NapC  26.24 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49270  cytochrome c-type protein NapC  25.74 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0776862  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  26.42 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  25.91 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  22.4 
 
 		 394 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  25.28 
 
 		 383 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1902  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.6 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.526119  hitchhiker  0.000000839402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2133  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.6 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  24.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  26.81 
 
 		 1672 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1844  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.6 
 
 		 195 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  hitchhiker  0.000210051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0369  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.48 
 
 		 204 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  26.09 
 
 		 155 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>