More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1406 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  74.71 
 
 
594 aa  706    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  100 
 
 
597 aa  1129    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  93.3 
 
 
597 aa  916    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  97.82 
 
 
597 aa  972    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.97 
 
 
610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.2 
 
 
607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.99 
 
 
598 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.59 
 
 
624 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.01 
 
 
605 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  32.54 
 
 
601 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  33.22 
 
 
596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.83 
 
 
590 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  26.89 
 
 
601 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.86 
 
 
626 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  26.29 
 
 
595 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  26.29 
 
 
595 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.58 
 
 
610 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.45 
 
 
586 aa  246  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.5 
 
 
615 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  30.68 
 
 
590 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.35 
 
 
618 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.96 
 
 
593 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  55.06 
 
 
243 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29 
 
 
604 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.19 
 
 
438 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.88 
 
 
536 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.88 
 
 
536 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  31.93 
 
 
557 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.24 
 
 
554 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.41 
 
 
558 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.45 
 
 
555 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  44.64 
 
 
112 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  25.93 
 
 
538 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  35.55 
 
 
893 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30 
 
 
442 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  32.57 
 
 
1186 aa  99  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  25 
 
 
521 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  33.2 
 
 
956 aa  97.8  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  25 
 
 
521 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.87 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  31.47 
 
 
1205 aa  94.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  35.41 
 
 
917 aa  94  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 
846 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.24 
 
 
445 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.86 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  35.44 
 
 
930 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 
846 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  35.32 
 
 
750 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  31.75 
 
 
897 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.91 
 
 
437 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.81 
 
 
903 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 
851 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 
900 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  30.6 
 
 
858 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  33.49 
 
 
882 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  35.51 
 
 
918 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  34.12 
 
 
870 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  34.12 
 
 
870 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 
881 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  31.02 
 
 
826 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  31.73 
 
 
858 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  31.32 
 
 
1091 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  34.72 
 
 
1014 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 
858 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  35.58 
 
 
896 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  35.11 
 
 
865 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  34 
 
 
850 aa  84.3  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 
968 aa  84.3  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 
867 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  35.9 
 
 
761 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 
870 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  33.03 
 
 
904 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  35.85 
 
 
867 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  34.18 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  33.05 
 
 
862 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  28.74 
 
 
868 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  31.44 
 
 
870 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3589  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 
885 aa  82  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  33.61 
 
 
896 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 
1085 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.36 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  33.47 
 
 
882 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 
887 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  31.5 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 
865 aa  81.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 
1088 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  31.71 
 
 
890 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  34.63 
 
 
910 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 
911 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  31.76 
 
 
898 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 
855 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  30.62 
 
 
872 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  30.08 
 
 
891 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 
864 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  30.7 
 
 
932 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  30.66 
 
 
882 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 
864 aa  78.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 
855 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  31.73 
 
 
884 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  31.73 
 
 
884 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>