More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2641 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  703    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  78.67 
 
 
347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  77.52 
 
 
347 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  74.93 
 
 
347 aa  547  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.96 
 
 
341 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.37 
 
 
341 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.2 
 
 
341 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.98 
 
 
353 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.89 
 
 
342 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.48 
 
 
341 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.33 
 
 
347 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.6 
 
 
341 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
364 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
364 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.72 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.13 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.54 
 
 
347 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
350 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
356 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.73 
 
 
346 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.02 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
346 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.45 
 
 
346 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  35.29 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  35.14 
 
 
360 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
342 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.37 
 
 
349 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
342 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.16 
 
 
342 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
341 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.16 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.43 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.01 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.01 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.01 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.01 
 
 
341 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.01 
 
 
341 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
341 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.01 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
344 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
344 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
341 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
343 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 
328 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.05 
 
 
336 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
347 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
344 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
348 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
343 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
348 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 
349 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.66 
 
 
343 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
343 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
336 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
342 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
341 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.62 
 
 
342 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.01 
 
 
342 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
347 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.98 
 
 
347 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
347 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
344 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
344 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
342 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
344 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
337 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
350 aa  149  6e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.43 
 
 
342 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.24 
 
 
350 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
350 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
348 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.87 
 
 
339 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.68 
 
 
347 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
342 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
340 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
341 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
338 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>