43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2522 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2522  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 182 aa  360  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  33.98 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  30.48 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  41.51 
 
 		 706 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4276  hypothetical protein  28.06 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  30.28 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  37.66 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  31.37 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  39.62 
 
 		 678 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 609 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  39.62 
 
 		 656 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  39.62 
 
 		 655 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1019 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  35.85 
 
 		 782 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  37.93 
 
 		 741 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 782 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 		 741 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 763 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  35.8 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 615 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 616 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 617 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  35.85 
 
 		 644 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 619 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  31.86 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  35.8 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 763 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 617 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 617 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 617 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 748 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 763 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 748 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 748 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.56 
 
 		 842 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 748 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1019 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  41.3 
 
 		 725 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  32.26 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  35.85 
 
 		 618 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  35.85 
 
 		 678 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  32.26 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  33.96 
 
 		 763 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>