67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1827 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
217 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  85.92 
 
 
213 aa  362  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  67.77 
 
 
213 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  65.73 
 
 
211 aa  294  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  66.2 
 
 
211 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  66.35 
 
 
213 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  65.55 
 
 
213 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  64.62 
 
 
211 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  53.88 
 
 
211 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  47.32 
 
 
194 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  47.83 
 
 
273 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  47.83 
 
 
192 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  47.42 
 
 
192 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  46.38 
 
 
192 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  47.34 
 
 
192 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  45.85 
 
 
193 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  43.96 
 
 
192 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  40.83 
 
 
202 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  43.14 
 
 
193 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  38.76 
 
 
205 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  38.39 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  36.56 
 
 
217 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  39.72 
 
 
180 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  33.79 
 
 
221 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  37.41 
 
 
154 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  35.59 
 
 
234 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  37.63 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  34.01 
 
 
195 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  34.01 
 
 
195 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 
195 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 
195 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  34.2 
 
 
196 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  32.56 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  32.56 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  38.46 
 
 
187 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  33.54 
 
 
186 aa  84.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  27.54 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  29.1 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  32.12 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  32.2 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  49.28 
 
 
84 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  52.31 
 
 
119 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  49.28 
 
 
84 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  28.08 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  29.82 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  31.75 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  29.29 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  29.94 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  41.25 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  31.3 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  29.3 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  30.67 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  29.41 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  31.29 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  31.21 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  24.28 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  25.97 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  33.68 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  36.84 
 
 
125 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  27.41 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  26.21 
 
 
145 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  34.44 
 
 
202 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  27.18 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  27.1 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2522  phage baseplate assembly protein V  35.8 
 
 
182 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>