45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0929 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
177 aa  359  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  42.22 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  37.68 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  36.73 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  35.76 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  35.76 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  35.1 
 
 
240 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  35.9 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  30.72 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  26.9 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  23.98 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  24.28 
 
 
217 aa  61.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  22.75 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  22.75 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  26.24 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  24.84 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  23.39 
 
 
213 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  25.43 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  22.54 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  25.88 
 
 
192 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  23.73 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  25.29 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  25.88 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  21.69 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  21.69 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  26.04 
 
 
273 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  26.47 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  21.74 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  24.82 
 
 
205 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  30.69 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  25.45 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  26.47 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  22.36 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  27.74 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  25.18 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  23.81 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  26.62 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  24.7 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  26.42 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  35.29 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  22 
 
 
217 aa  44.3  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  27.34 
 
 
602 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  25.55 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  23.84 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  26.28 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>