58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1573 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  96.89 
 
 		 193 aa  353  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  48.95 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  48.52 
 
 		 240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  47.26 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  43.21 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  45.79 
 
 		 159 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  37.5 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  34.97 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  32.8 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  34.17 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  31.61 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  29.11 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  29.11 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  33.85 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  38.41 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  30.41 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  30.41 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  31.01 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  29.29 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  31.35 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  30.3 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  30.3 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  30.27 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  27.04 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  31.22 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  27.33 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  28.8 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  26.55 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  25.32 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  28.57 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  26.58 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  27.22 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  29.17 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  27.68 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  30.5 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  32.53 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  31.71 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  32.28 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  29.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  32.2 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  25.97 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  23.73 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  37.5 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  29.02 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  22.11 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  25.71 
 
 		 301 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  23.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  32.37 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  32.37 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  23.84 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  24.24 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 615 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>