32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2910 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  100 
 
 		 198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  33.33 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  33.33 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  33.33 
 
 		 240 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  36.36 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  36.36 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  30.72 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  32.43 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  31.01 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  27.74 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  29.41 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  29.41 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  29.41 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  29.41 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  33.98 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  27.41 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  26.28 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  24.82 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  27.97 
 
 		 154 aa  51.6  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  25.93 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  26.49 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  25 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  25 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  25.77 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  28.86 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  24.82 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  27.78 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  26.85 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  30.93 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  24.89 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  21.79 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  26.74 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>