50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4960 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  53.85 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  43.21 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  35.06 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  35.06 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  35.06 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  35.06 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  41.36 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  34.48 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  33.33 
 
 		 211 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  34.21 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  32.73 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  30.12 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  33.33 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0929  phage baseplate assembly protein V  35.43 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  31.58 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  30.13 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  31.58 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  38.89 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  30.73 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  31.58 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  29.66 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  28.14 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  30.65 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  30.52 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  30.34 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  30.11 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  30.34 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  30.34 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  30.43 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  29.66 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  29.86 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  32.73 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  29.41 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  27.51 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  24.38 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  28.1 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  29.17 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  27.27 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  27.4 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  26.88 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  31.03 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  28.83 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  24.69 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  23.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  28.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  26.86 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  27.83 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  26.9 
 
 		 210 aa  42  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>