37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0687 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  30.8 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  34.93 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  30.92 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  27.92 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  32.03 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  28.33 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  28.23 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  32.53 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  28.5 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  30.2 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  27.4 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  25.49 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  29.45 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6629  hypothetical protein  29.03 
 
 		 607 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  32.03 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  32.48 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  25.71 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  27.7 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  27.5 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  28.21 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  27.1 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  30.52 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  34.26 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  26.4 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  30.23 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  25.88 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  28.39 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  30.73 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  28.19 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  26.7 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  27.92 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  36.47 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  32.56 
 
 		 192 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  30.77 
 
 		 240 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  26.99 
 
 		 193 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>