35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1139 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  38.84 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  39.47 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  38.98 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  38.14 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  37.39 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  31.11 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  33.91 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  32.76 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  32.76 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  31.03 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  31.9 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  24.84 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  34.44 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  33.03 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  31.03 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  33.77 
 
 		 84 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  33.77 
 
 		 84 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  33.77 
 
 		 119 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  35.87 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  32.77 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  35.58 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  34.78 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  35.21 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  33.33 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  30.53 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  29.31 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  28.1 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  27.78 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  27.35 
 
 		 301 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  27.57 
 
 		 186 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  30.86 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  26.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  32.5 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>