42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1976 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  100 
 
 
312 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  50.9 
 
 
288 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  49.19 
 
 
292 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  38.72 
 
 
285 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  41.76 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
285 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  36.86 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
288 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
288 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  40.72 
 
 
285 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  40.72 
 
 
285 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  40.64 
 
 
288 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  40.27 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  40.27 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  40.27 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  40.27 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  40.27 
 
 
285 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  38.66 
 
 
319 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
285 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  37.44 
 
 
229 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  41.01 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  40.43 
 
 
192 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
287 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
283 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  40 
 
 
282 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 
357 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
284 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
284 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  35.45 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  34.9 
 
 
232 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  31.97 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>