139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1607 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  39.85 
 
 
295 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  35.54 
 
 
306 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  29.86 
 
 
338 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  34.78 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  33.11 
 
 
349 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  32.98 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  31.75 
 
 
296 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  30.56 
 
 
304 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  29.47 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  29.86 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  28.62 
 
 
290 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  31.96 
 
 
418 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  33.46 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  27.69 
 
 
300 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  32.41 
 
 
315 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  28.41 
 
 
301 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  29.6 
 
 
296 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  30.35 
 
 
289 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  29.6 
 
 
296 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  30.04 
 
 
299 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  28.67 
 
 
297 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.67 
 
 
296 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  31.76 
 
 
312 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  32.16 
 
 
312 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  30.29 
 
 
303 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  28.34 
 
 
300 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  30.4 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  26.15 
 
 
283 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  30.53 
 
 
286 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  30.53 
 
 
286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  30.53 
 
 
286 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  29.67 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  26.98 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  30 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  30.74 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  26.28 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  30.08 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  30.52 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  30.52 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  32.16 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  30.27 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  28.4 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  29.34 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  30.07 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  29.46 
 
 
289 aa  95.5  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  29.96 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  29.55 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  30.52 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  30.92 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  27.08 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  26.18 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  29.44 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  29.46 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  28.51 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  28.68 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  30.62 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  28.68 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  28.68 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  26.86 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  29.06 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  28.68 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  26.81 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  26.67 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  28.11 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  28.11 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  28.57 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  29.13 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  26.36 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  28.11 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  28.11 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  28.11 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  28.11 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  29.03 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  28.63 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.18 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  26.38 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.27 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.18 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  28.7 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  29.03 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  36.19 
 
 
327 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1245  Beta-lactamase  27.27 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.694796  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  23.96 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  26.17 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  27.95 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  26.4 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.4 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  25.79 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  25.1 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4048  Beta-lactamase  27.27 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.55 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  25.59 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  22.82 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  26.17 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  25.9 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  25.9 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  23.76 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>