47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4429 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4429  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 		 177 aa  357  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.364472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2746  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000389389  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  41.56 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  29.2 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl081  single-stranded DNA-binding protein  41.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.34874e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  40 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  24.85 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  39.24 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  38.16 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 301 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  38.16 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  27.33 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  27.13 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  35.8 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  27.98 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  26.76 
 
 		 305 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  32.1 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  26.15 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 112 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 119 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0139  single-strand binding protein family  35.8 
 
 		 138 aa  42  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0258473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  32.8 
 
 		 192 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  31.5 
 
 		 159 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.71 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  32.8 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  26.83 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  33.78 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  35.9 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1664  single-strand binding protein  31.45 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286469  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  28.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  34.21 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  28.68 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0031  single-strand binding protein family  32.1 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.97 
 
 		 195 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  28.82 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>