21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3564 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  100 
 
 
623 aa  1221    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  52.83 
 
 
660 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  42.72 
 
 
676 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  30.48 
 
 
645 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  29.09 
 
 
649 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  29.37 
 
 
649 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  32.29 
 
 
646 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  30.97 
 
 
644 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  30.48 
 
 
601 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  30.68 
 
 
597 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  29.64 
 
 
598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  32.72 
 
 
628 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  30.32 
 
 
581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  29.63 
 
 
566 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.5 
 
 
647 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  24.4 
 
 
637 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  23.7 
 
 
628 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  24.04 
 
 
847 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  25.99 
 
 
629 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  26.03 
 
 
618 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  23.92 
 
 
626 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>