35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1514 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  123  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  55 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  55 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  51.67 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  53.33 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  51.61 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  42.11 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  48.39 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  40.98 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  35 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  38.1 
 
 		 124 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  33.9 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  37.5 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 88 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>