23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0300 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  38.71 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  38.84 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  35.16 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  34.43 
 
 
306 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  32.5 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  32 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  35.11 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  31.4 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  31.2 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  27.64 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  27.56 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  29.03 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  29.66 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  29.69 
 
 
154 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  27.34 
 
 
147 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  22.79 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1183  hypothetical protein  23.85 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  30.63 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>