39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3513 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3513  putative RecX protein  100 
 
 		 168 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3449  putative RecX protein  97.01 
 
 		 167 aa  243  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3367  putative RecX protein  95.24 
 
 		 168 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3431  putative RecX protein  77.11 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  40.26 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  33.76 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.49 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  22.78 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  27.98 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.41 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.16 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  30.68 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  27.98 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  32.57 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  37.21 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  34.21 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  37.01 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  33.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 226 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  28.29 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 264 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.89 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  26.55 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  22.78 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.59 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.52 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  31.29 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  35.86 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  21.88 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.5 
 
 		 214 aa  40.8  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  23.93 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  33.54 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>