More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1860 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  855    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  97.18 
 
 
426 aa  781    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  49.24 
 
 
437 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  48.74 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  41.56 
 
 
432 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  41.32 
 
 
432 aa  326  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  40.67 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  42.13 
 
 
384 aa  286  7e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  34.61 
 
 
430 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  34.61 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  34.86 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  35.02 
 
 
430 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
443 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  36.23 
 
 
443 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  34.3 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  34.06 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  32.49 
 
 
425 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  32.49 
 
 
425 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  30.07 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  33.81 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  29.83 
 
 
428 aa  216  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  34.2 
 
 
434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  31.86 
 
 
443 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  30.63 
 
 
446 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  30.63 
 
 
446 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  30.29 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  30.29 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  31.89 
 
 
428 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  30.28 
 
 
445 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  31.63 
 
 
428 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  30.02 
 
 
426 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.99 
 
 
417 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  30.07 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  29.9 
 
 
423 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  29.66 
 
 
423 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  29.83 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  30.39 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  29.66 
 
 
427 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  30.49 
 
 
427 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.19 
 
 
434 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.71 
 
 
434 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
441 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  28.76 
 
 
366 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  28.49 
 
 
366 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.78 
 
 
451 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.05 
 
 
428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.43 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  29.63 
 
 
410 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  29.26 
 
 
410 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  27.05 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.94 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  23.08 
 
 
411 aa  133  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  27.84 
 
 
432 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
424 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  27.84 
 
 
429 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.74 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  25.12 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.57 
 
 
418 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
421 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
425 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
421 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
415 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  25.83 
 
 
399 aa  117  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
439 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1033  permease, putative  23.21 
 
 
409 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.187473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 
432 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  26.63 
 
 
412 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  26.2 
 
 
418 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  24.77 
 
 
427 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  28.14 
 
 
420 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
438 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  28.68 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
439 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  25.36 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  24.56 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  24.53 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  24.86 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  28.01 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
392 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
446 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  23.04 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  21.41 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.35 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  25.2 
 
 
442 aa  87  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  23.84 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.86 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  25.13 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  26.61 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  24.19 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  25.8 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.22 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>