25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0164 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  100 
 
 		 601 aa  1239    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0495  S-type pyocin family protein  90.62 
 
 		 480 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.21565  hitchhiker  0.00238856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  93.07 
 
 		 612 aa  938    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  37.08 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  36.34 
 
 		 789 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  52.38 
 
 		 859 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  34.1 
 
 		 656 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  34.62 
 
 		 655 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  35.69 
 
 		 731 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  33.43 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  33.25 
 
 		 758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  35 
 
 		 593 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  30.91 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0494  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.557626  normal  0.0118474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  33.85 
 
 		 740 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  36.43 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  30.32 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  24.29 
 
 		 862 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 83 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  29.52 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  26.67 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  29.92 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0532  S-type pyocin domain-containing protein  28.29 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  32.98 
 
 		 106 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1293  hypothetical protein  38.64 
 
 		 73 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00285181  normal  0.594635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>