More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0085 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 
253 aa  515  1e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  75.89 
 
 
253 aa  405  1e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  68.77 
 
 
252 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  66.4 
 
 
252 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  66.4 
 
 
252 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 
251 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  66.27 
 
 
250 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  65.18 
 
 
249 aa  358  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  67.2 
 
 
249 aa  349  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 
251 aa  345  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  63.56 
 
 
249 aa  344  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.54 
 
 
251 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  65.6 
 
 
250 aa  342  3e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  64.94 
 
 
251 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  65.84 
 
 
251 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  64.54 
 
 
262 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  64.54 
 
 
251 aa  337  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
250 aa  336  3e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  63.75 
 
 
251 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  62.55 
 
 
251 aa  334  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
250 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
250 aa  333  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
250 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
250 aa  331  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  63.35 
 
 
251 aa  331  7e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
251 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 
251 aa  328  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 
280 aa  328  5e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  63.93 
 
 
252 aa  326  2e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  64.17 
 
 
249 aa  325  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  60.62 
 
 
273 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  64.37 
 
 
280 aa  322  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  63.97 
 
 
280 aa  321  8e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  63.27 
 
 
248 aa  320  2e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  61.73 
 
 
247 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  64 
 
 
249 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  60.96 
 
 
251 aa  317  9e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  64.14 
 
 
251 aa  316  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  64.46 
 
 
254 aa  315  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  60.56 
 
 
257 aa  314  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  64.2 
 
 
247 aa  314  9e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  60.48 
 
 
252 aa  314  1e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  61.02 
 
 
254 aa  314  1e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  63.27 
 
 
252 aa  314  1e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 
251 aa  312  4e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  8.23487e-07 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  63.64 
 
 
256 aa  311  6e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
254 aa  309  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60.8 
 
 
249 aa  309  3e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  62.86 
 
 
252 aa  309  3e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  59.2 
 
 
261 aa  307  1e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  9.97935e-08 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  60 
 
 
247 aa  306  2e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  58 
 
 
250 aa  306  2e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  58.8 
 
 
249 aa  305  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  59.09 
 
 
253 aa  304  8e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  60.08 
 
 
260 aa  304  8e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  6.68282e-08 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  59.11 
 
 
258 aa  303  1e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  59.29 
 
 
257 aa  304  1e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  60.33 
 
 
249 aa  303  1e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  60 
 
 
262 aa  302  3e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  61.14 
 
 
243 aa  300  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 
254 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  61.98 
 
 
261 aa  298  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  57.43 
 
 
250 aa  298  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  57.26 
 
 
248 aa  297  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  56.5 
 
 
250 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
250 aa  295  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
253 aa  294  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 
261 aa  294  9e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  57.2 
 
 
256 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  57.44 
 
 
246 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  56.5 
 
 
250 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
250 aa  293  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  61.16 
 
 
263 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  57.2 
 
 
247 aa  291  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  58.26 
 
 
255 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  57.38 
 
 
261 aa  291  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  56.05 
 
 
254 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  57.85 
 
 
271 aa  288  5e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  59.09 
 
 
244 aa  288  7e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  59.09 
 
 
244 aa  288  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  54.33 
 
 
257 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  57.44 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  9.84202e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  57.44 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  4.51745e-07 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  57.44 
 
 
248 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  56.05 
 
 
248 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  57.2 
 
 
248 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  57.2 
 
 
248 aa  286  3e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  57.2 
 
 
262 aa  285  3e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  55.24 
 
 
248 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  57.02 
 
 
248 aa  285  6e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  57.02 
 
 
248 aa  285  6e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.73069e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  54.84 
 
 
248 aa  283  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  57.85 
 
 
261 aa  283  1e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  58.26 
 
 
256 aa  283  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.26 
 
 
256 aa  283  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  57.26 
 
 
264 aa  281  5e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  57.44 
 
 
256 aa  281  5e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  55.97 
 
 
248 aa  281  8e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  56.2 
 
 
248 aa  281  8e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  56.2 
 
 
248 aa  281  8e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>