More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0019 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0019  transcription antitermination protein NusG, putative  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000223141  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  48.07 
 
 
181 aa  155  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0957  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 
179 aa  154  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  38.42 
 
 
176 aa  132  4e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  37.64 
 
 
185 aa  131  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.98 
 
 
176 aa  130  2e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  37.29 
 
 
176 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  37.29 
 
 
176 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  37.29 
 
 
176 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 
176 aa  129  4e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  38.42 
 
 
176 aa  128  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 
176 aa  127  8e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  38.42 
 
 
176 aa  127  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  37.29 
 
 
176 aa  127  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  37.85 
 
 
176 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  37.85 
 
 
185 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
176 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 
176 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
176 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  36.16 
 
 
176 aa  124  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.61776e-05  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 
176 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.68519e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  33.9 
 
 
176 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
177 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  36.16 
 
 
176 aa  120  1e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  36.72 
 
 
176 aa  120  1e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  36.16 
 
 
177 aa  120  2e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  36.93 
 
 
177 aa  120  2e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  36.16 
 
 
177 aa  120  2e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
177 aa  120  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  36.16 
 
 
177 aa  120  2e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  38.2 
 
 
177 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  32.12 
 
 
189 aa  119  4e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  35.8 
 
 
177 aa  118  4e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  35.75 
 
 
178 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
175 aa  117  1e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
175 aa  117  1e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  34.46 
 
 
175 aa  115  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  34.66 
 
 
177 aa  115  4e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  34.24 
 
 
182 aa  115  4e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.95897e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  36.46 
 
 
179 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  33.87 
 
 
182 aa  114  7e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.18825e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  35.8 
 
 
174 aa  114  7e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  35.03 
 
 
177 aa  113  1e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  32.99 
 
 
185 aa  113  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  8.22613e-07 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  32.99 
 
 
185 aa  113  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  33.7 
 
 
182 aa  112  4e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  33.71 
 
 
185 aa  112  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  37.5 
 
 
177 aa  111  7e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  30.93 
 
 
194 aa  111  7e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  111  8e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  7.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  111  8e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  111  8e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  8.47824e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  111  8e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  30.21 
 
 
190 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.59472e-06  hitchhiker  2.26007e-11 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  33.33 
 
 
199 aa  110  1e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  32.47 
 
 
185 aa  110  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.649e-05  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  33.15 
 
 
181 aa  109  2e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  35.03 
 
 
176 aa  110  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  30.93 
 
 
194 aa  109  2e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  33.15 
 
 
181 aa  109  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  34.27 
 
 
179 aa  108  4e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  33.9 
 
 
177 aa  108  4e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  32.58 
 
 
177 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  1.62097e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  32.58 
 
 
177 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  33.9 
 
 
180 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.73451e-06  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  32.61 
 
 
181 aa  108  6e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  32.39 
 
 
177 aa  108  7e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  31.61 
 
 
191 aa  108  7e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  8.19878e-08  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  33.9 
 
 
183 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.25102e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  33.15 
 
 
181 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  36.93 
 
 
175 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  4.51246e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  33.15 
 
 
181 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
177 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 
183 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.38288e-08  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  29.84 
 
 
190 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.73158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  33.9 
 
 
183 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.71251e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  37.29 
 
 
175 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  33.9 
 
 
177 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  31.84 
 
 
201 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.37761e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  32.96 
 
 
179 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.71893e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.83625e-05  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.52563e-08  hitchhiker  5.86315e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.38759e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  7.83565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.1444e-09  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  32.61 
 
 
181 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.94784e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  33.7 
 
 
181 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.36415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 
175 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>