More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5002 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  69.66 
 
 
507 aa  635  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
512 aa  1027  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  67.4 
 
 
507 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  67.4 
 
 
507 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  61.87 
 
 
506 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  57.64 
 
 
571 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  49.08 
 
 
500 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  49.6 
 
 
512 aa  447  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.19 
 
 
498 aa  446  1e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  47.62 
 
 
543 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.95 
 
 
515 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.06 
 
 
504 aa  416  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.69 
 
 
504 aa  417  1e-115  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.58 
 
 
516 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.62 
 
 
505 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.58 
 
 
523 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  47.32 
 
 
528 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.48 
 
 
520 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.45 
 
 
527 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.24 
 
 
507 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  46.42 
 
 
507 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.13 
 
 
528 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.69 
 
 
542 aa  407  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  46.48 
 
 
516 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.78 
 
 
526 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.13 
 
 
484 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.36 
 
 
479 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.53 
 
 
484 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.9 
 
 
537 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.78 
 
 
484 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  44.74 
 
 
484 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.6 
 
 
484 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.86 
 
 
501 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.9 
 
 
505 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  46.9 
 
 
505 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.9 
 
 
505 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.9 
 
 
505 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.99 
 
 
484 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  44.2 
 
 
484 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  46.71 
 
 
505 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.5 
 
 
488 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.71 
 
 
505 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.71 
 
 
505 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.32 
 
 
518 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  45.12 
 
 
515 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.86 
 
 
530 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.57 
 
 
496 aa  362  8e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  44.56 
 
 
490 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  43.81 
 
 
480 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.89 
 
 
488 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.19 
 
 
480 aa  358  2e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.62 
 
 
487 aa  356  4e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.3 
 
 
504 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  46.51 
 
 
484 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.12 
 
 
493 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  45.54 
 
 
592 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  45.88 
 
 
484 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  44.44 
 
 
476 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  39.59 
 
 
499 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  40.77 
 
 
493 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.8 
 
 
492 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  43.41 
 
 
496 aa  340  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  44.6 
 
 
461 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  39.55 
 
 
496 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.84 
 
 
481 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.56 
 
 
492 aa  327  4e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  41.56 
 
 
492 aa  326  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.44 
 
 
467 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  41.65 
 
 
485 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.24 
 
 
486 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  41.8 
 
 
467 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.15 
 
 
467 aa  321  2e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  41.41 
 
 
483 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.24 
 
 
485 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.24 
 
 
485 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.24 
 
 
468 aa  319  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  37.52 
 
 
494 aa  315  1e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.95 
 
 
497 aa  312  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.01 
 
 
484 aa  284  3e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.3 
 
 
514 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.33 
 
 
490 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.64 
 
 
552 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.16 
 
 
470 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
450 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  28.83 
 
 
1363 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  28.78 
 
 
1387 aa  164  5e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.8 
 
 
275 aa  129  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  45.91 
 
 
158 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.21 
 
 
164 aa  122  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.97 
 
 
289 aa  122  1e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.29 
 
 
276 aa  122  1e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.42 
 
 
161 aa  122  1e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.4 
 
 
164 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  49.32 
 
 
161 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  31.27 
 
 
280 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.79 
 
 
173 aa  120  5e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  33.1 
 
 
294 aa  120  8e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.13 
 
 
284 aa  120  8e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.51 
 
 
215 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.35 
 
 
163 aa  118  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>