More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1481 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.7 
 
 
506 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
571 aa  1173    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  57.64 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  57.48 
 
 
507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  56.93 
 
 
507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  58.01 
 
 
507 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.68 
 
 
512 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  45.12 
 
 
543 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.3 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.3 
 
 
498 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  41.85 
 
 
500 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.55 
 
 
504 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.01 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  43.74 
 
 
516 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.24 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.31 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.5 
 
 
523 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.68 
 
 
520 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  42.31 
 
 
528 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.37 
 
 
505 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.13 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.35 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  39.82 
 
 
507 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.78 
 
 
507 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.16 
 
 
542 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.28 
 
 
530 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  42.26 
 
 
505 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.09 
 
 
505 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  42.09 
 
 
505 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.53 
 
 
493 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.09 
 
 
505 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.26 
 
 
505 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.09 
 
 
505 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  42.09 
 
 
505 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  41.09 
 
 
484 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.38 
 
 
537 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.18 
 
 
479 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  41.68 
 
 
515 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.91 
 
 
484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  41.82 
 
 
592 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.64 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.55 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.18 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.24 
 
 
484 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.79 
 
 
518 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  37.82 
 
 
484 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.96 
 
 
496 aa  336  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  37.77 
 
 
480 aa  336  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.6 
 
 
501 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  38.72 
 
 
496 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  38.74 
 
 
496 aa  334  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.41 
 
 
492 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.03 
 
 
504 aa  333  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.61 
 
 
487 aa  333  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.74 
 
 
488 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  37.48 
 
 
490 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  39.05 
 
 
484 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  35.43 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  38.5 
 
 
484 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.14 
 
 
488 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  38.32 
 
 
483 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  37.04 
 
 
476 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  37.99 
 
 
492 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  37.52 
 
 
493 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.63 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  37.81 
 
 
485 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  39 
 
 
485 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.64 
 
 
485 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.92 
 
 
480 aa  317  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.77 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.35 
 
 
467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.28 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37 
 
 
481 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.57 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  36.9 
 
 
467 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  36.8 
 
 
494 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.98 
 
 
467 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.02 
 
 
484 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.13 
 
 
514 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.57 
 
 
468 aa  276  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.94 
 
 
490 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.22 
 
 
552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  29.8 
 
 
470 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.2 
 
 
450 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  26.32 
 
 
1363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  38.46 
 
 
1387 aa  123  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.29 
 
 
275 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.07 
 
 
276 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  37.76 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  37.76 
 
 
161 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4326  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.74 
 
 
161 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.74 
 
 
284 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  38.74 
 
 
165 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  38.61 
 
 
164 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.06 
 
 
164 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.52 
 
 
164 aa  107  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.89 
 
 
287 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
1350 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0425  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  37.06 
 
 
169 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.56858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1782  (2Fe-2S)-binding  37.7 
 
 
165 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>