38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4978 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  54.55 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  46.22 
 
 		 416 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  50.41 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  49.44 
 
 		 391 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  48.51 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  46 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.01 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.64 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  42.15 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  39.12 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  37.61 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  37.32 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  39.37 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  42.21 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  37.5 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  39.89 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  39.34 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  39.34 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.44 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  37.32 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.45 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.76 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  39.61 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.08 
 
 		 412 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  39.29 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  37.5 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  40.64 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  35.61 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  39.64 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  34.49 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  39.64 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  36.69 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  34.59 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.55 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>