27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3607 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  91.03 
 
 
860 aa  279  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  90.34 
 
 
777 aa  276  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  89.66 
 
 
1196 aa  273  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  88.97 
 
 
756 aa  271  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  88.28 
 
 
768 aa  266  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  87.59 
 
 
764 aa  266  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  84.83 
 
 
790 aa  258  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  82.07 
 
 
770 aa  254  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  88.97 
 
 
465 aa  251  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  80 
 
 
768 aa  248  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  81.38 
 
 
889 aa  246  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  77.4 
 
 
3864 aa  239  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  78.77 
 
 
819 aa  239  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  78.77 
 
 
873 aa  238  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  77.4 
 
 
7434 aa  238  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  77.4 
 
 
954 aa  234  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  75 
 
 
4830 aa  231  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  75.51 
 
 
781 aa  229  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  74.48 
 
 
763 aa  228  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  74.66 
 
 
479 aa  224  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  62.5 
 
 
1641 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  60.69 
 
 
3340 aa  190  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  54.42 
 
 
4428 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  54.05 
 
 
2796 aa  150  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  53.47 
 
 
1099 aa  145  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.52 
 
 
746 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>