More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3208 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  100 
 
 		 323 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  68.2 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  66.79 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  66.79 
 
 		 302 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  57.42 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  60.49 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  60.79 
 
 		 331 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  51.09 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  53.45 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  48.84 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  49.81 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  47.97 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  47.64 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  48.51 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  50.37 
 
 		 271 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  49.64 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  48.53 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  49.08 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  48.08 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  49.45 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  48.06 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  48.66 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  48.54 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  48.09 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  47.66 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  46.51 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  43.96 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  45.59 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  48.48 
 
 		 277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  41.3 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  38.52 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  32.88 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.47 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.47 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.47 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.47 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.47 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  30.94 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  31.56 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.03 
 
 		 355 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  30.65 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  30.57 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  31.09 
 
 		 274 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  26.92 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.64 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  28.04 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  27.84 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  31.76 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  31.2 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  31.76 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.37 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  30.42 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  29.27 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  27.08 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  25.75 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  29.85 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  27.45 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  27.45 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  28.31 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  27.76 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  30.15 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  28.68 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  30.26 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  27.91 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.98 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  28.35 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  28.67 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  30.35 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  27.08 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  27.91 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  28.67 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.98 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  27.44 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  30.68 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  27.91 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.83 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  31.2 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  32.47 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  25.41 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  28.47 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  29.92 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>