228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0057 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  43.78 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  43.58 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  38.86 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  39.53 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  39.31 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  35.87 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.29 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  37.17 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.14 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  39.13 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.78 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  35.33 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  31.19 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  36.02 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  31.25 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  32.35 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  32.52 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  32.98 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  37.71 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.04 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  38.76 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  35.2 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  35.03 
 
 		 188 aa  88.2  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  35 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  35.5 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  34.92 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  32.43 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  35.5 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  32.93 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  32.26 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  35.53 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  39.11 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  39.11 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  35.35 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  33.67 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  33.67 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  32.93 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  35.33 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.09 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  36.7 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  34.09 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  29.53 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  36.21 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  32.02 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  34.55 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  29.51 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  35 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  32.98 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  32.98 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  35.93 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.6 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.08 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  32.8 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  32.77 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  31.38 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  35.12 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  29.61 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  32.54 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  32.54 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  32.54 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  32.54 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  32.26 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.85 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  32.54 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  32.14 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  33.14 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  30.17 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  31.78 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  31.58 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  33.81 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  31.95 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  32.4 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  32.58 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  33.71 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  30.9 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.71 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  33.71 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  29.95 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  32.62 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  31.12 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  32.11 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  31.29 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.67 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  34.81 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>