228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1115 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  66.25 
 
 		 160 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  69.38 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  68.75 
 
 		 160 aa  227  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  65 
 
 		 160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  63.75 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 		 161 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 		 161 aa  206  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 		 161 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  61.49 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  59.51 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 160 aa  195  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  60.87 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  55.83 
 
 		 163 aa  193  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  58.13 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 160 aa  190  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  57.5 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  56.25 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  54.94 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  52.17 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 		 161 aa  167  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  54.37 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  51.55 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  54.94 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  52.17 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  51.88 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  50.62 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>