68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0063 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  76.54 
 
 		 455 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  83.56 
 
 		 438 aa  712    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  81.66 
 
 		 454 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  905    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  66.13 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  67.56 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  68.65 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  68.42 
 
 		 451 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  67.05 
 
 		 461 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  67.96 
 
 		 452 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  67.73 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  67.96 
 
 		 452 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  67.96 
 
 		 452 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  67.73 
 
 		 452 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  67.73 
 
 		 452 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  67.73 
 
 		 452 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  66.82 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  67.05 
 
 		 443 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  67.28 
 
 		 452 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  63.19 
 
 		 452 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  63.15 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  54.02 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  53.35 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  47.88 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  46.05 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  52.36 
 
 		 479 aa  405  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  44.87 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  46.59 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  46.59 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  46.84 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  43.54 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  45.91 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  31.03 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  30.54 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  31.32 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  30.89 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  30.11 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  30.89 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  31.32 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  30.39 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  29.52 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  29.52 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  29.52 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  29.69 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  29.69 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  31.39 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  30.41 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  27.43 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  32.58 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  28.76 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  28.76 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  28.63 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  29.53 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  28.57 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  28.38 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  31.5 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  27.91 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  28.41 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  31.75 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  25.45 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  32.48 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  39.74 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  25.68 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  32.32 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  35.05 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  27.52 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  34 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0938  nucleoside recognition  31.25 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000955347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>