32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1716 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  762    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  61.6 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06390  hypothetical protein  49.48 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  50 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0327  hypothetical protein  46.83 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  47.74 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  27.4 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  26.92 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  26.92 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  26.92 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  26.92 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  23.53 
 
 		 463 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  24.88 
 
 		 452 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  25.48 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  25.48 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  25.96 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  24.52 
 
 		 452 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  27.05 
 
 		 450 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  27.27 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  24.52 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  25.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  25.67 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  25 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  22.93 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  22.3 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  22.3 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  23.58 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  21.18 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  22.93 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  22.12 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>