More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0026 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
351 aa  710    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  45.29 
 
 
235 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  44.84 
 
 
235 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  44.64 
 
 
251 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  44.14 
 
 
233 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  44.2 
 
 
243 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  43.5 
 
 
255 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  43.5 
 
 
255 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  43.5 
 
 
262 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  46.22 
 
 
281 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  45 
 
 
262 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  42.08 
 
 
257 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  43.89 
 
 
251 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  41.2 
 
 
264 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  42.6 
 
 
235 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  47.87 
 
 
262 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  41.34 
 
 
271 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  41.96 
 
 
265 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  42.41 
 
 
244 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  43.44 
 
 
255 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  40.81 
 
 
238 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  42.99 
 
 
255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  41.26 
 
 
232 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  42.53 
 
 
257 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  43.5 
 
 
288 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  41.07 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  40.15 
 
 
292 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  41.3 
 
 
233 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1247  30S ribosomal protein S2  39.5 
 
 
239 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  40.93 
 
 
268 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  40.93 
 
 
268 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  42.34 
 
 
255 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  42.22 
 
 
252 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  42.53 
 
 
251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0157  30S ribosomal protein S2  40.35 
 
 
230 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  42.47 
 
 
267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  41.96 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  39.82 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  38.35 
 
 
269 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  41.08 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  40.54 
 
 
316 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  40.89 
 
 
264 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  41.26 
 
 
232 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  41.78 
 
 
252 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  43.36 
 
 
324 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  41.63 
 
 
256 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1222  30S ribosomal protein S2  40 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10101  30S ribosomal protein S2  40.89 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0824098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  43.23 
 
 
262 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0761  30S ribosomal protein S2  40.62 
 
 
233 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  43.42 
 
 
260 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  40.36 
 
 
262 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  41.85 
 
 
307 aa  196  6e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08141  30S ribosomal protein S2  40.44 
 
 
234 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08131  30S ribosomal protein S2  40.44 
 
 
234 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16641  30S ribosomal protein S2  39.73 
 
 
239 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.503664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  41.38 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  41.96 
 
 
243 aa  195  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  46.45 
 
 
263 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08311  30S ribosomal protein S2  40.44 
 
 
234 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.419677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  41.52 
 
 
257 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  43.42 
 
 
257 aa  195  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07891  30S ribosomal protein S2  40.72 
 
 
222 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.992425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  41.07 
 
 
300 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  40.27 
 
 
254 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  41.7 
 
 
280 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  40.27 
 
 
271 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  38.91 
 
 
260 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  41.38 
 
 
256 aa  192  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  41.82 
 
 
248 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  42.6 
 
 
260 aa  192  8e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  40.54 
 
 
273 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  40.18 
 
 
258 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  38.22 
 
 
251 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  41.78 
 
 
255 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  40.83 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  37.5 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  38.84 
 
 
262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  39.64 
 
 
284 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  40.09 
 
 
287 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  39.64 
 
 
284 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  39.64 
 
 
284 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  40.09 
 
 
272 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  40.54 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  40 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  40.71 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  40.81 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0705  ribosomal protein S2  41.55 
 
 
250 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000421001  unclonable  0.0000000254138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  40.09 
 
 
279 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  41.41 
 
 
236 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>