90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0045 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1117  hypothetical protein  28.97 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0279  formate dehydrogenase accessory protein  29.32 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1004  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  29.21 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1577  putative formate dehydrogenase formation protein  26.43 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.396578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1197  formate dehydrogenase accessory protein  28.42 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_174  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase accessory protein  26.33 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0185  formate dehydrogenase accessory protein FdhE, putative  28.93 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0706  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  28.74 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0608  formate dehydrogenase accessory protein  27.12 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1332  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  22.81 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0167  hypothetical protein  25.19 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000455155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0038  protein involved in formate dehydrogenase formation  26.43 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0557  formate dehydrogenase accessory protein  28.49 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0503  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  24.64 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2641  formate dehydrogenase accessory protein  29.89 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0951215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0796  hypothetical protein  23.64 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0648  formate dehydrogenase accessory protein  24.22 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1233  formate dehydrogenase accessory protein  28.26 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0243277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3515  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  22.22 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2375  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  28.81 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.826547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1572  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation-like protein  28.25 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3371  hypothetical protein  28.81 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2086  putative formate dehydrogenase formation protein  32.47 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1870  formate dehydrogenase accessory protein  32.26 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1791  putative formate dehydrogenase formation protein  32.26 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0285  formate dehydrogenase accessory protein  25.49 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.135303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0982  formate dehydrogenase accessory protein  25.48 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21810  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  31.48 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.218643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1276  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11250  uncharacterized protein involved in formate dehydrogenase formation  23.21 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.787821  normal  0.730398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2589  hypothetical protein  25.49 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0456  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.624877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0871  hypothetical protein  30.06 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1679  formate dehydrogenase accessory protein  30.19 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0290178  normal  0.051951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4088  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4425  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4269  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.4 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3590  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.78 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.510238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3487  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.93 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4247  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.4 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4360  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.4 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4314  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.4 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0645  formate dehydrogenase accessory protein  30.77 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0493202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4127  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4277  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4420  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4119  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5341  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03725  hypothetical protein  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03776  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.6 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4370  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.19 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1822  putative formate dehydrogenase formation protein FdhE  32.5 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4093  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  24.19 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1815  formate dehydrogenase accessory protein  26.35 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.608787  normal  0.064168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2011  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  32.79 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4521  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.81 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3041  putative formate dehydrogenase formation protein  35.9 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.856963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1568  formate dehydrogenase formation protein FdhE, putative  21.91 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2550  formate dehydrogenase accessory protein  26.2 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469755  normal  0.436108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0108  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0103  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0107  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03840  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.36 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1053  formate dehydrogenase protein FdhE  27.42 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.568728  normal  0.759475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0104  fdhE protein  31.17 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0710  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.87 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63550  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0301804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3813  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.27 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1902  formate dehydrogenase accessory protein  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1680  formate dehydrogenase accessory protein  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0727  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0100  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0574  formate dehydrogenase accessory protein  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.893619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0105  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  31.17 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1695  formate dehydrogenase accessory protein  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.672608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2393  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0413827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3757  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.27 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2256  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.87 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6557  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.87 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232874  decreased coverage  0.000781967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4594  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.46 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0729287  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5528  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  30 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3380  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.66 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2866  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.47 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0914212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0659  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  25.48 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0343732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3897  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  27.27 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1997  formate dehydrogenase protein fdhE  25.67 
 
 		 193 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0927353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2701  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3987  formate dehydrogenase accessory protein FdhE  28.7 
 
 		 316 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>