79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3303 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  37.59 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  37.01 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  37.1 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  33.92 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  39.63 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  36.86 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  32.13 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  28.83 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  31.09 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  27.68 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  27.53 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  36.49 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  27.59 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  26.07 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  28.63 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  26.1 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  25.51 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  25.94 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  27.13 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  24.91 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  24.91 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  24.91 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  24.83 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  24.83 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.69 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  24.83 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.58 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  32.68 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  35.96 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  30.94 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  25.83 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  25.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  27.46 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  26.44 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  26.09 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  34.55 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.65 
 
 		 357 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  25.42 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  25.42 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  25.82 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1176  putative very short patch repair protein  38.55 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  26.45 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  26.62 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  26.19 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01962  hypothetical protein  39.06 
 
 		 103 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  32.84 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1421 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  25.41 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  28.29 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  24.38 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  25.41 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29.49 
 
 		 1403 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2197  putative very short patch repair protein  36.14 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0715413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  26.57 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  25.86 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  29.17 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  33.87 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  33.8 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  25.57 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  25.57 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  25.57 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  33.62 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.78 
 
 		 1490 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  31.65 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  23.33 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  30.25 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  28.23 
 
 		 200 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>