More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3043 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
402 aa  825    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.89 
 
 
409 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  53.5 
 
 
407 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.1 
 
 
394 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53 
 
 
395 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.85 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  56.67 
 
 
395 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.54 
 
 
398 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  50.52 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  51.04 
 
 
453 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
453 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
452 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  48.62 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.3 
 
 
404 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.17 
 
 
399 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
382 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.14 
 
 
385 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.7 
 
 
442 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  50.55 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.75 
 
 
396 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.23 
 
 
466 aa  345  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
396 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  46.49 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  46.21 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.96 
 
 
414 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 
408 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.18 
 
 
410 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
411 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.9 
 
 
392 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 
397 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.39 
 
 
396 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 
404 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.04 
 
 
395 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
386 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.07 
 
 
392 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.6 
 
 
402 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.64 
 
 
396 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.69 
 
 
401 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.9 
 
 
392 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.43 
 
 
386 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
402 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.6 
 
 
392 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.8 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.52 
 
 
419 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  38.38 
 
 
392 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  38.8 
 
 
396 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.9 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.69 
 
 
384 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  38.54 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.03 
 
 
399 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 
393 aa  269  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 
387 aa  269  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 
387 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 
396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.03 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.54 
 
 
397 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.98 
 
 
387 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.29 
 
 
396 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.63 
 
 
415 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
387 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.26 
 
 
394 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.83 
 
 
430 aa  258  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 
396 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 
386 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  38.5 
 
 
391 aa  257  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1133  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.05 
 
 
398 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.8 
 
 
385 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.28 
 
 
398 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.66 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.23 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.23 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25572  predicted protein  37.31 
 
 
470 aa  252  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.01 
 
 
394 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.88 
 
 
385 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.67 
 
 
389 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.24 
 
 
404 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.72 
 
 
404 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  37.7 
 
 
395 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 
391 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  36.98 
 
 
404 aa  249  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  37.44 
 
 
408 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.81 
 
 
386 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1661  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.8 
 
 
406 aa  249  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0842003  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.34 
 
 
386 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2813  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.48 
 
 
404 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.46 
 
 
404 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.08 
 
 
394 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
393 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03020  Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  35.88 
 
 
426 aa  247  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.388117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  35.82 
 
 
394 aa  247  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.72 
 
 
391 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355643  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2728  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.23 
 
 
403 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.335629  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0539  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  35.51 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.2 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.71 
 
 
394 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  36.72 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1037  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.56 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>