More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1034 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  100 
 
 
297 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  79.46 
 
 
304 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  72.73 
 
 
298 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  72.73 
 
 
298 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  72.73 
 
 
298 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  73.72 
 
 
312 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  73.15 
 
 
305 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  70.17 
 
 
297 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  67.22 
 
 
306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  67.69 
 
 
301 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  65.46 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  67.46 
 
 
297 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  64.59 
 
 
307 aa  387  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  62.79 
 
 
305 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  63.16 
 
 
303 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  60.34 
 
 
297 aa  358  6e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  60.07 
 
 
283 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  59.23 
 
 
293 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  59.23 
 
 
293 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  59.79 
 
 
281 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  60.14 
 
 
281 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  55.86 
 
 
291 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  54.93 
 
 
285 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  55.48 
 
 
289 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  53.17 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  51.03 
 
 
296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  50.55 
 
 
286 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  50.91 
 
 
275 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 
301 aa  281  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  50.9 
 
 
277 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
277 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  50.36 
 
 
283 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  49.45 
 
 
279 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  50.91 
 
 
282 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 
282 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  51.48 
 
 
275 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  48.57 
 
 
288 aa  275  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  51.09 
 
 
279 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  48.39 
 
 
287 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  49.1 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  50.55 
 
 
279 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  48.34 
 
 
281 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  49.82 
 
 
281 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  51.66 
 
 
279 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  48.38 
 
 
277 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  49.45 
 
 
279 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  48.38 
 
 
277 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  48.71 
 
 
279 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  49.63 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  49.82 
 
 
277 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 
281 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  44.75 
 
 
295 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  44.96 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  43.86 
 
 
285 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  44.24 
 
 
308 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  45.77 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
289 aa  232  6e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 
355 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 
340 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 
297 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  42.25 
 
 
293 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  42.44 
 
 
321 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  41.88 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 
290 aa  191  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
366 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  33.22 
 
 
277 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 
283 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.39 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.92 
 
 
279 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  33.22 
 
 
276 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  29.02 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.56 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  29.41 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
324 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.71 
 
 
287 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  30.41 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.98 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
283 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  32.86 
 
 
281 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  30.55 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.55 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1836  Rhodanese domain protein  30.74 
 
 
371 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  35.38 
 
 
335 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  31.72 
 
 
286 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>