More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0072 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  100 
 
 
225 aa  448  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  83.11 
 
 
225 aa  399  1e-110  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  71.11 
 
 
225 aa  331  5e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  69.91 
 
 
227 aa  305  3e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
229 aa  130  2e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
238 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  29.78 
 
 
238 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  28.64 
 
 
341 aa  114  1e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  34.22 
 
 
238 aa  113  2e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 
820 aa  112  4e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  28.18 
 
 
341 aa  112  4e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
351 aa  110  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  33.63 
 
 
476 aa  111  1e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1341  nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
230 aa  110  2e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  1.68829e-06  normal  0.809045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
776 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
348 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  29.33 
 
 
238 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  29.09 
 
 
345 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.08573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
238 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
243 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 
367 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 
348 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 
821 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 
818 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
384 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30 
 
 
361 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 
830 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.39 
 
 
361 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
785 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
346 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.44 
 
 
784 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
351 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 
346 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
370 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
828 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.26 
 
 
784 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.26 
 
 
784 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.78 
 
 
820 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  28.05 
 
 
352 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.63 
 
 
784 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.55 
 
 
320 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.38 
 
 
835 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.63 
 
 
784 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.05 
 
 
393 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 
361 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  36.53 
 
 
384 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
816 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
370 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 
388 aa  95.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
827 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  29.83 
 
 
818 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
712 aa  94.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.61 
 
 
841 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
854 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
237 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  1.62703e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
393 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30 
 
 
832 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  28.87 
 
 
832 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  25.68 
 
 
348 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  25.45 
 
 
350 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  25.45 
 
 
350 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  33.46 
 
 
248 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
843 aa  91.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
353 aa  91.7  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
833 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.79 
 
 
352 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
841 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.58 
 
 
842 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
370 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
842 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.27 
 
 
842 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  29.6 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
334 aa  89.4  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
830 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  29.58 
 
 
828 aa  88.6  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.46 
 
 
343 aa  88.6  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  25.45 
 
 
348 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 
354 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 
352 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  30 
 
 
396 aa  88.6  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  26.36 
 
 
361 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  27.83 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  32.2 
 
 
842 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.15 
 
 
353 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  34.73 
 
 
383 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.36 
 
 
832 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>