262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1000 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1000  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
237 aa  471  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0107196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1251  peptidase M22 glycoprotease  52.07 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0110331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  29.91 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0053  peptidase M22, glycoprotease  35.14 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  29.11 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  29.15 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0053  peptidase M22 glycoprotease  33.79 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.384179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  29.52 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0340  peptidase M22 glycoprotease  30.67 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0597828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  26.25 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  31.93 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  28.16 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  29.18 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  27.92 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  26.81 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  29.05 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  26.58 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  29.77 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  25.27 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  31.3 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  24.22 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  29.05 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  24.15 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  27.43 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  24.56 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  24.56 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  30.06 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  25.23 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  30.56 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  27.56 
 
 
231 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  34.04 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  30.65 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2294  peptidase M22 glycoprotease  30.58 
 
 
175 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  27.06 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  34.13 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  25.33 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  34.13 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  24.12 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  26.44 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  24.66 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  29.03 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  24.66 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  24.66 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  26.61 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  27.39 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  34.29 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  32.56 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  33.57 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  24.45 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  25.78 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  27.87 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  27.27 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  28.82 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  27.61 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  24.66 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  28.51 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  24.66 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  24.51 
 
 
281 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  24.73 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  23.11 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  28.15 
 
 
229 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  23.11 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  28 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  26.84 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  26.82 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  28.49 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  26.5 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  23.11 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  25.39 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  23.11 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  23.11 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  23.51 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  23.51 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  24.57 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  26.38 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  28.73 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  28.8 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  26.47 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  22.71 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  22.84 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1525  peptidase M22, glycoprotease  31.54 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.365073  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  23.56 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  24.24 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  22.47 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  31.88 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  24.28 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  22.27 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  25.93 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  25.3 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  23.81 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  30.71 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  29.89 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  26.09 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  28.8 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>