More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0012 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.01 
 
 
288 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.6 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  45.26 
 
 
310 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  41.75 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.21 
 
 
288 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
286 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.03 
 
 
290 aa  248  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.11 
 
 
291 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.02 
 
 
282 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 
292 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.67 
 
 
282 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.47 
 
 
652 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.67 
 
 
282 aa  238  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.48 
 
 
292 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.77 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.33 
 
 
291 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.65 
 
 
285 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  42.41 
 
 
293 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.36 
 
 
287 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 
290 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  41.09 
 
 
291 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.95 
 
 
292 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.85 
 
 
267 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.83 
 
 
286 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.29 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.38 
 
 
289 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.71 
 
 
287 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  40.29 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  34.14 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.07 
 
 
296 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
289 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.1 
 
 
280 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.6 
 
 
275 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.83 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.32 
 
 
292 aa  179  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.97 
 
 
288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.4 
 
 
284 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 
288 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  37.05 
 
 
285 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.99 
 
 
276 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.66 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 
283 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
284 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.77 
 
 
285 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.45 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.38 
 
 
283 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.45 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.98 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  31.84 
 
 
311 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  32.81 
 
 
292 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 
301 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
288 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
277 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.7 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  29.79 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.16 
 
 
351 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.22 
 
 
286 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  28.32 
 
 
268 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 
286 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.89 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  23.89 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  25.76 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  23.55 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  46.43 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
655 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  22.53 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.37 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  33.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  22.07 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  24.49 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  22.07 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
370 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  23.45 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.09 
 
 
57 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1464  cell division ATPase MinD  30.28 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.245456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  24.07 
 
 
271 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.75 
 
 
848 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.98 
 
 
369 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0299  cell division ATPase MinD  30.28 
 
 
261 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  37.84 
 
 
792 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  26.04 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1615  cell division ATPase MinD  30.28 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.424529  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
1013 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>