More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1115 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  100 
 
 		 149 aa  293  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  69.66 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  71.72 
 
 		 152 aa  213  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  68.09 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  69.01 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  66.9 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  64.54 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  64.34 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  64.79 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  57.64 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  64.23 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  61.03 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  56.94 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  53.47 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  53.47 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  60.42 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  60.42 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  54.23 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  52.7 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  51.08 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  51.8 
 
 		 146 aa  139  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  47.3 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  47.3 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  51.03 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  50.36 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  50 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  51.75 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  47.48 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  50.71 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.01 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  47.48 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  44.68 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  45.86 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  46.48 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  44.29 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  46.62 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  46.81 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  45.32 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  46.97 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  46.21 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  45.93 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  50 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  46.04 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  45.77 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  45.32 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  46.1 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  44.22 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  45.65 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  45.52 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>